La baie de Bourgneuf constitue le principal site conchylicole de la région des Pays de Loire.
Elle est limitée, au sud, par la commune de La Barre de Monts, au nord, par la Pointe de Saint–Gildas et protégée par une immense digue naturelle: l’île de Noirmoutier.
La superficie de la baie est 34 000 hectares. La profondeur moyenne de la baie est d’environ 10 mètres. Le marnage est de 5 à 6 mètres en période de «malines» et de 3 à 4 mètres en période de mortes–eaux. La circulation de la mer dans la baie est essentiellement induite par les marées. La Loire, située au nord de la Pointe de Saint-Gildas, influe peu sur cette circulation d’eau. De faibles apports d’eau douce sont assurés périodiquement au sud de la baie par 4 petits étiers et au nord par l’étier du Falleron, le canal de la Haute Perche et de manière irrégulière par une partie des eaux de la Loire.
La partie côtière du marais présente une topographie propice au développement de claires ostréicoles.
